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IMC W411 制限酵素登録・実行ダイアログ

制限酵素の検索、登録、絞り込み、サブセット作成、認識部位検索などの機能を持つダイアログです。

My Set プルダウンメニュー:プルダウンメニューから登録済の制限酵素サブセットを選択します。

Type 選択セクション:制限酵素のリストを絞り込みます。チェックしたTypeだけがリストに表示されます。複数チェックした場合は、同一行にあるチェックボックス間の選択の場合は、OR条件、異なる行間チェックボックスの場合は、AND条件となります。

認識部位塩基長:制限酵素の認識部位の塩基長で選択します。複数チェックすると、OR条件で選択されます。

4bp チェックボックス:4塩基認識の制限酵素

6bp チェックボックス:6塩基認識の制限酵素

8bp チェックボックス:8塩基認識の制限酵素

other チェックボックス:4,6,8塩基認識以外の制限酵素

Palindromic:回分構造の有無で選択します

Palindromic チェックボックス:回分構造の認識部位をもつ制限酵素

Not Palindromic チェックボックス:回分構造ではない認識部位をもつ制限酵素

末端形状:制限後の末端が示す形状で選択します。

Blunt End チェックボックス:平滑末端を生成する制限酵素

Sticky End 5’- チェックボックス:5’末端が突出した粘着末端を生成する制限酵素

Sticky End 3’- チェックボックス:3’末端が突出した粘着末端を生成する制限酵素

メチル化の影響部位:DAMおよびDCMメチル化酵素により影響を受ける認識部位をもつ制限酵素が表示されます。

Dam チェックボックス:DAM メチラーゼによる影響部位をもつ制限酵素

Dcm チェックボックス:DCM メチラーゼによる影響部位をもつ制限酵素

フィルタリングセクション:認識部位検索後、対象DNAを認識する部位数で絞り込みます。

Show All ラジオボタン:認識部位検索結果をすべて表示します。

Show Any Enzyme which has…:指定した範囲の認識部位数をもつ結果のみを表示します。

from テキストフィールド:ゼロまたは正の整数値を入力します。この数以上の認識部位を表示します。

to テキストフィールド:ゼロまたは正の整数値を入力します。

Dam チェックボックス:チェックすると、DAM メチラーゼによる影響を受ける認識部位を表示します。

Dam カラーボックス:DAM メチラーゼによる影響を受ける認識部位を指定したカラーで表示します。

Dcm チェックボックス:チェックすると、DCM メチラーゼによる影響を受ける認識部位を表示します

Dcm カラーボックス:DCM メチラーゼによる影響を受ける認識部位を指定したカラーで表示します。

Enzyme Listセクション:検索対象とすると制限酵素とその認識配列、切断箇所などが表示されます。

チェックボックス:チェックすると、検索対象とします。

Enzyme 名称:制限酵素名称

Recognition Site: 認識配列と切断箇所

Editable:「False」は、編集不可を示します。「True」は編集可能で、チェックしてEditボタンで編集できます。

選択ボタンセクション:制限酵素リストのチェックボックスにまとめてチェックするボタン

Select All ボタン:クリックすると、リストにある制限酵素すべてのチェックボックスにチェックします。

Reverse Selected ボタン:クリックすると、現在チェックされている制限酵素のチェックが外され、チェックされていない制限酵素にチェックされます。

範囲指定セクション カレントゲノム配列上の検索対象範囲を指定します、デフォルトでは、配列全体が指定されています。

From テキストフィールド:正の整数を入力します。選択開始塩基位置

To: テキストフィールド:選択終了塩基位置。Fromより大きな正の整数値を入力します。

Change ボタン:上記の数値を変更した場合は、このボタンをクリックすると、変更が適用されます。

コマンドセクション:選択された制限酵素に対するコマンドを実行するボタン群です。

Show Recognition Site… ボタン:選択された制限酵素の認識部位を検索します。

Map… ボタン:選択された制限酵素地図を別ウィンドウに表示します。

Add… ボタン:リストにない制限酵素を新規追加します。

Edit… ボタン:選択された制限酵素(複数選択不可)を編集します。編集可能な制限酵素のみ。

Delete ボタン:選択された制限酵素(複数選択可)を削除します。

Restore ボタン:制限酵素リストを初期値に戻します。

Add to My Set ボタン:選択された制限酵素をMy Setに登録します(複数指定可)。

Delete My Set ボタン:My Setから選択された制限酵素を削除します(複数指定可)。

Close ボタン:Enzyme Selection ダイアログを閉じます。

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