ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

インシリコバイオロジー株式会社 公式技術情報サイト

機能メニュー

ようこそ, ゲスト
ユーザ名: パスワード: シークレットキー 自動ログイン
  • ページ:
  • 1

トピック:

IMC: MiGAPの出力結果をIMCで読み込んだ際に注釈にある改行コードが文字化けしているようです。 14 年 7 ヶ月 前 #145

MiGAPの結果のGenBank形式ファイルをIMCで読み込んだ際に、改行コードかなにかを文字化けして取り込んでしまうようで、個々のCDSのdescription window 内のAnnotation表記などに変な記号 \zx がまぎれています。

これを回避できますか?

2010/11/12 「TN大学Kさんから指摘」代理投稿しました。-Agent User-

ログイン は対話に参加してください。

最終編集: : AgentUser-sp-1336637799.

注釈中のWord Wrapを保存するために最近変更された仕様です。IMC内部だけで使用されます。 14 年 7 ヶ月 前 #147

これは、元の注釈のWord Wrapを保持するためにVersion 4.2.4から変更されたIMC正規仕様で、「\zx」はDescription WindowとAnnotation Window上でのみ改行コードを可視化するためにIMC内だけで設定されたものです。

GenBank/EMBLファイルに出力すると改行に変換され、見えなくなります。

IMC Developer

ログイン は対話に参加してください。

最終編集: : akr-sp-1212728882.

フィーチャー定義ファイルであるCSV形式ファイルには「\zx」文字が残っています。 14 年 7 ヶ月 前 #148

フィーチャー定義ファイルであるCSV形式で出力したファイルには「\zx」の文字が残っていました。

2010/11/12 「TN大学Kさんからの指摘」代理投稿しました。-Agent User-

ログイン は対話に参加してください。

Re: フィーチャー定義ファイルであるCSV形式ファイルには「\zx」文字が残っています。 14 年 7 ヶ月 前 #149

CSV形式の場合は、可視化するため「\zx」が残っていました。改行コードに戻すように検討してみます。

それまでの対処方法としては、
1.エディターソフト(NoEditorなど)でCSVファイルを読込ます。
www.vector.co.jp/soft/winnt/writing/se300436.html
2.「\zx」をたとえば「zzx」などに全置換します。
3.「zzx」を「\r\n」に全置換します。この場合は「正規表現」にチェックします。

IMC Developer

ログイン は対話に参加してください。

IMC Version 4.2.13にてこの問題を解決しました。 14 年 5 ヶ月 前 #258

これまで、IMC内部では改行コードを別な文字列"\zx"に置き換えて保持していましたが、IMC Version 4.2.13から改行コードを内部的にもそのまま保持するようになりました。

IMC Developer

ログイン は対話に参加してください。

  • ページ:
  • 1
ページ作成時間: 0.041 秒

Site Seal

最新更新記事