IMCでHomology Search by Input Sequenceを実行しようとすると、"Please set up blast and formatdb command"というエラーメッセージが表示され、実行できません。

blastの設定は、通常はインストール時に自動的に設定されるのですが、インストール時になにかトラブルが発生し、自動設定できなかったものと思われます。

これは、Blastへのリンク設定を行うことで解決できます。

1. メニュー⇒Option Setting ⇒Option ⇒Commandsタブパネルを開きます。
2. 一番上のフィールドにblastall.exe、2番のフィールドにformatdb.exe、をRefボタンを使って設定します。
3. Applyボタンをクリックします。

以上で、blastを実行できるようになります。