ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

インシリコバイオロジー株式会社　公式技術情報サイト

ホームメニュー　(insilicobiology.co.jp に移動します）

サイト内全文検索

サイト内ポピュラータグ

trouble 5 SNP 6 Qualifier 10 navigation 4 Mutation 5 Local Genome Rearrangement Map 6 Linear Map 9 License 5 Lane 9 Genome Design 7 Gene Cluster Alignment 8 Frame 6 Feature Map 6 Feature Layout Style 5 feature key 5 Feature 6 download 4 Codon 4 BLAST 11 Activation 4

最新製品リリース情報

バグ・トラブル報告

機能メニュー

ようこそ, ゲスト
ユーザ名: パスワード: シークレットキー 自動ログイン
パスワードをお忘れですか？ ユーザ名をお忘れですか？
フォーラム・インシリコ
Forum GenomeTraveler
Questions (GT)
Gapped Alignmentの設定について
  • ページ:
  • 1

トピック:

Gapped Alignmentの設定について 14 年 3 ヶ月 前 #342

MetagenomeGAMBLERに実装されていました2bp程度のGapを加えたマッピング（gapped alignment)を実行したいのですが、どうすればよろしいでしょうか？設定方法をお教えください。:huh:

ログイン は対話に参加してください。

GTにはGapped Alignmentはまだ実装されていません。 14 年 3 ヶ月 前 #343

回答が遅れて申し訳ありません。

Gapped Alignemt機能は、MGG:MetaGenomeGAMBLERには搭載されておりますが、この処理は実行時間がかなりかかるため、現在のところGTには実装されていません。
処理時間の短縮のための改良が完了した段階で実装する予定です。

GT Developer

ログイン は対話に参加してください。

Re: Gapped Alignmentの実装予定時期 14 年 3 ヶ月 前 #348

Short Read側へのギャップ挿入については、2011年3月末までに実装する予定です。
Reference Gennome側へのギャップ挿入機能については、2011年4月末までに実装する予定です。

GT Developer

ログイン は対話に参加してください。
  • ページ:
  • 1
フォーラム・インシリコ
Forum GenomeTraveler
Questions (GT)
Gapped Alignmentの設定について
ページ作成時間: 0.034 秒

フォーラム　メニュー

Site Seal

IMCのこんな機能使ってみませんか？

最新更新記事