生成されたScaffoldに含まれるコンティグのリストを見るには、
現状では各Scaffoldを選択して、Contig Listボタンを押す必要があります。

これは手間ですので、全てのScaffoldに対して、ContigListを自動的に生成して欲しいです。

現在の機能であるScaffold Projectノードから起動できるScaffold Viewerには、生成された全Scaffoldのリストとそれをクリックすることにより、以下のようにそれぞれのScaffoldを構成するContigのリストが表示されますが、これでは不十分でしょうか？あるいは、これに加えてCSVファイル出力が必要でしょうか？
http://www.wikiinsilico.org/index.php?GT_ScaffoldViewer

Scaffoldの数が200以上あるので、各Scaffoldに含まれるコンティグを、一度の操作でCSVに出力して頂けると、助かります。

ご要望を今後の開発機能にリストアップし、なるべく早いリリースのGT Versionに実装します。