遺伝子情報がCDSのFeatureだけで登録されたGenbankファイルがあります。
本来はバクテリアであれば、CDSと同じ領域にgeneのFeatureも登録されています。

他のツールではgeneのFeatureでないと遺伝子として認識されないので、
CDSのFeatureを一括してgeneとしてコピーしたいです。

その際、CDSのQualiferはできるだけgeneにコピーしたいです。

回答が遅れて申し訳ありません。
現在のVersionではFeatureを一括して別のFeature Keyに変更する機能はあります。
1. 変更対象のFeature Keyを持つFeatureのみを表示して、ゲノム全領域を選択します。
2. マウス右クリックで表示されるメニューからChange Feature...を選択します。
3. 変更先Feature Keyを指定して、実行すると全可視Feature が変更先Feature Keyになります。
4.　この時、元のFeatureのQualifierのうち変更先のFeature Keyで認められていないQualifierは持ち越されません。
5.　元のFeature Keyはなくなります。

FeatureをCSV出力して、Feature Keyを変更し、それをインポートする方法でも可能ですが、
やはりQualifierは変更先に規定に縛られます。

コピー機能は今後の追加機能として開発スケジュールに載せます。
しかし、すべてのQualifierを持ち越す件は、規約から外れるため、検討中です。