ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

インシリコバイオロジー株式会社 公式技術情報サイト

ようこそ, ゲスト
ユーザ名: パスワード: シークレットキー 自動ログイン
  • ページ:
  • 1

トピック:

IMC: アレイ版、タイリングアレイのプローブファイルbpmapファイルの一部のプローブがインポートできない 14 年 7 ヶ月 前 #121

今タイリングアレイのprobe importを行っています。
bpmapファイルをインポートしたのですが、プローブが抜けてしまいます(約2000ほど)。
bpmapからProbeExporterV2を使ってbpmap.txtを作るとそのプローブは存在します。

なのでProbeExporterV2を使ってbpmap.txtを作成し、それをIMCに読み込ませようとしていますが、
添付のエラーになります(Probe Nameカラムには何もいれることができません)。

BPMAPはこちらでは中身の確認ができませんが、ProbeExporterでプローブがある以上、BPMAPにないはずは
ないです。

そこで
1、IMCでのBPMAP読み込みは大丈夫なのか?なぜぬけるのか?
2、ProbeExporterをつかって作ったプローブはなぜIMCに読み込めないのか?

以上教えて頂けますでしょうか?

2010/10/25 「NS大Mさんからの連絡」代理投稿しました。-Forum Administrator-

ログイン は対話に参加してください。

最終編集: : akr-sp-1212728882.

Re: IMC: アレイ版、タイリングアレイのプローブファイルbpmapファイルの一部のプローブがインポートできない 14 年 7 ヶ月 前 #122

バグでした。

原因は、23塩基長のプローブがあったためです。
BPMAPではプローブ長が25塩基長と想定されていました。

本日、バグフィックス版IMC Version 4.2.5をリリースいたしました。

なお、bpmat.txtが読めない問題は、現在まだ調査中です。

ログイン は対話に参加してください。

最終編集: : akr-sp-1212728882.
  • ページ:
  • 1
ページ作成時間: 0.034 秒

Site Seal

最新更新記事