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トレーニングデータを使用してフラグメントマッピング操作を練習します。

操作

GTを起動します。

「last_mapping」ノードの上でマウス右クリックします。

メニューが表示されます。

「New Analysis Node -> Fragment Mapping」を選択します。

Fragment Mapping ダイアログが表示されます。

Add… をクリックして、デモデータ（トレーニングデータ）の中から、*-demo.fasta　というファイルを選択します。

全てのチェックボックスにチェックします。

Run　をクリックします。

実行確認メッセージが表示されます。

「はい（Y)」をクリックします。

実行が開始され、実行中は進捗メッセージが表示されます。

マッピング処理が完了すると、完了メッセージが表示されます。

「OK」をクリックします。

last_mapping ノードのAnalysisノードの一番上に今回のマッピング結果のノードが作成されます。

そのノード上でマウス右クリックし、表示されたメニューからExpandを選択するか、ノードをダブルクリックします。

ノードの下にbamファイルノードが表示されます。

そのbamファイルノード上で、マウス右クリックします。

メニューが表示されます。

「Show Read Alignment」を選択します。

マッピング結果を閲覧・解析するための、Alignment Viewer　が表示されます。