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実装製品・エディション

プラスミドへのインサートチェック用に適した制限酵素を表示します。

また、そのゲル電気泳動をシミュレートします。

用意するデータ

1. ベクター塩基配列ファイル
2. インサート塩基配列ファイル

• あるいは、PCRや制限酵素処理により任意の塩基配列ファイルから作成します。

操作概要

1. IMCを起動します。
2. ベクター塩基配列ファイルを読み込みます。
   • まず、ベクター配列の開環を行います。
3. Cloning --> RE Recognitionを選択します。
4. そのベクター上のMCS (Multi Cloning Site)にある認識部位をもつ制限酵素を選択します。
5. Show Recognition Siteボタンをクリックします。
6. その制限酵素の認識部位の数が表示されます（通常は１となります）。
7. その制限酵素にチェックします。
   • 右側パネルに制限酵素部位の情報が表示されます。
8. 部位にチェックします。
9. Digestion ボタンをクリックします。
   • Digestion Listが表示されます。
10. チェックを入れます。
11. Loadボタンをクリックしてロードします。
12. Recognition Siteウィンドウをクローズします。
    • 以上でベクターの開環は完了します。
    • 次にライゲーション反応を行います。
13. インサート配列を読み込みます
    • （あるいはテンプレート配列をPCRする、
    • 任意の塩基配列を制限酵素消化切断するなどの方法もあります）。
14. Cloning --> Ligationボタンをクリックします。
    • Ligationダイアログが表示されます。
15. 開環されたベクター配列を1stに、インサート配列を2ndに選択します。
16. Ligation ボタンをクリックします。
    • Ligation産物リストが表示されます。
17. インサートチェックする産物にチェックします（複数指定可能）。
    • インサートチェックに最適な制限酵素のリストが表示されます。
18. 選択して、GelElectrophoresisボタンをクリックします。
    • ゲル電気泳動のシミュレーションが表示されます。