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ISB Nomenclature

インシリコバイオロジー社の用語集です。

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Glossaries

Term Main definition
GSM

ゲノム規模のバイオモデル、特に代謝モデル、SBML Formatなどで記述される。IMCではExcelフォーマットでも入出力できる。

あるいは Group List パネルの略号

 

参照数 - 95
Synonyms - Genome Scale Model,ゲノムスケールモデル
Grp

Group が登録されている ゲノムスケールモデルを読み込むと、作成されるリストパネルの略号、デフォルト位置:Center1

参照数 - 82
Synonyms - Group List
Group Editor

Group を登録し、さらに Group の下に Reaction を登録するためのエディターダイアログ。

参照数 - 81
Synonyms - GroupEditor,グループエディター
Group

同一機能あるいは同一パスウェイに属するReactionの集合に対する名称、

Synonyms - Subsystem,LocalPathway,SubPathway,局所パスウェイ,ローカルパスウェイ
Global Genome Rearrangement Map

近縁種ゲノムを広域的に比較し、全体構造の違いを図示する機能

参照数 - 71
Synonyms - 広域ゲノム再配置地図
Genome Traveler

インシリコバイオロジー株式会社が開発したNGS解析ソフトウェア

参照数 - 1139
Synonyms - ゲノムトラベラー,GT
Genome Scale Model

ゲノム規模のバイオモデル、特に代謝モデル

参照数 - 97
Synonyms - ゲノムスケールモデル,GSM
genetic code table

遺伝子をコードするゲノム領域をアミノ酸に翻訳するための変換表。

参照数 - 875
Synonyms - 遺伝暗号表,コドン表
Gene Cluster Alignment

複数のゲノムの間で、1つの遺伝子に着目し、その遺伝子を含む近傍全体のアラインメントを表示する機能。IMCGE以上に実装。

参照数 - 15
Synonyms - 遺伝子クラスターアラインメント,ジーンクラスターアラインメント
FeatureMap

ゲノム配列上に注釈された生物学的特徴(フィーチャー)をその位置に従い、意味ある形状やカラーで地図様に表示したもの。

参照数 - 93
Synonyms - フィーチャーマップ
Feature Registration Dialog

Feature 登録用ダイアログ:Description Windowと機能は同じ

参照数 - 310
Feature Lane

メインフィーチャーマップの部品のひとつ。指定したフィーチャーキーをもつフィーチャーを様々なフォーマットで表示できる。各フィーチャー上から実行できる解析機能が豊富。

参照数 - 76
Synonyms - フィーチャーレーン
Feature Key

フィーチャーのタイプ、種類

参照数 - 1023
Synonyms - フィーチャーキー,FK
FastA

塩基配列あるいはアミノ酸配列フォーマット。定義行と配列行からなる。

参照数 - 1069
Synonyms - fasta
ExR

Extendable Reaction List パネルの略号

参照数 - 120
Synonyms - Extendable Rxns List,ExtendableRxnsList

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