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ISB Nomenclature

インシリコバイオロジー社の用語集です。

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Glossaries

Term Main definition
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ダイアログなどで変更した設定を適用しないで設定ダイアログを閉じるための操作ボタン。

参照数 - 665
Synonyms - クローズ
Classification

IMCが独自に設定した Qualifier、フィーチャーのカラー分類に使用。

参照数 - 842
Synonyms - classification
Circular Genome Map

環状のゲノム地図を作成する機能。地図をカスタマイズし、デザインをスタイルとして保存可能。IMCGE以上に実装されている。

参照数 - 13
Synonyms - 環状ゲノムマップ,同心円ゲノムマップ,環状マップ,同心円マップ
CDS

ゲノム塩基配列上で遺伝子をコードしている領域。

参照数 - 1238
Synonyms - 遺伝子コーディング領域
Category

フィーチャーを自由に分類するために使用されます。デフォールトでは主として、アノテーションの段階を分類するために使用されます。

参照数 - 778
Synonyms - annotation_grade,カテゴリー
BPMAP

Affymetrix社のアレイファイルフォーマット。ゲノム上のプローブ位置情報を含む。IMCAE以上で使用される。

参照数 - 491
Binary Best Hit

相同性検索などで、Query と Subject を入れかえても、ヒットされたSubjectのリストでベストスコアになる関係。

参照数 - 751
Synonyms - BBH
Batch Primer Design

多数の領域をそれぞれ増幅するためのPrimer Setを一括して設計すること。IMCに実装されている。

参照数 - 462
Synonyms - バッチプライマー設計
Batch Homology Search

多数のフィーチャーをクエリーとして、まとめて相同性検索を実行する機能を示す。IMCGE以上に実装されている。

参照数 - 652
Synonyms - バッチホモロジー検索,一括ホモロジー検索,自動ホモロジー検索
Batch

まとめて実行すること。一括操作。

参照数 - 914
Synonyms - バッチ,一括
BAM

ゲノム配列にマッピングしたリード情報を含むバイナリー形式フォーマット。SAMToolから出力されるフォーマット。GenomeTravelerで読み込み、アラインメント表示できる。

参照数 - 1520
Synonyms - Binary Alignment Map
Auto Copy

ホモロジー検索の結果ヒットしたSubjectから必要な注釈を自動的に転記する機能。自動的にコピーするQualifierを指定できる。IMCに実装。

参照数 - 694
Synonyms - Copy Qualifier,自動転記
Auto Annotation

自動アノテーション機能。IMCGE以上に実装されている。

参照数 - 612
Synonyms - 自動アノテーション
AUGUSTUS

ドイツ、ゲッチンゲン大学において開発された真核生物遺伝子予測ソフトウェア。

参照数 - 1034
Apply

ダイアログなどで設定を適用する操作ボタン。

参照数 - 767

SureServer for SAKURA(EV)