ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

描画例

~ imcimgI05/IMC5204_C806_0031.png

使用するソフトウェア

• 
• GT

操作方法

1. カレントmain配列フォルダーにプラスミド地図を描画するプラスミド配列をロードします。
2. その配列ノードをクリックします。
   • その配列がカレント配列になり、MainFeatureMap上に描画されます。
3. 異なる色で表示したいフィーチャー上でマウス右クリックします。
   • メニューが表示されます。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0037.png,50
4. Set Qualifier --> Colorをクリックします。
   • カラーパレットが表示されます。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0036.png,50
5. 任意のカラーを選択し、Setボタンをクリックします。
   • そのフィーチャーが指定したカラーで描画されます。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0038.png
6. 指定されたカラーで描画されない場合は、メインフィーチャーマップのカラーボタンFKをクリックします。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0039.png
   • カラーボタンがFKからQに切り替わり、そのフィーチャーの描画色が指定した色になります。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0040.png
7. MenuからCloning --> PlasmidMapを選択します。
   • 確認メッセージが表示されます。
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0025.png
8. はいをクリックします。
   • カレント配列（Plasmid)に異種の挿入DNA配列がライゲーションされている場合にはSelectInsertDialogが表示されます。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0026.png
9. 異種挿入配列領域を選択します。
   • 
   • imcimgI05/IMC5204_C806_0027.png
10. Setボタンをクリックします。
    • Plasmid Map Viewerが表示されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0033.png,50%
11. Plasmid Map Layout StyleからDefault Setを選択し、Setボタンをクリックします。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0032.png
    • Insert DNAとPlasmid Regionにデフォールトレーンが表示されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0034.png,50%
12. + Insert DNAに表示されたレーンにチェックし、Editボタンをクリックします。
    • Insert Lane Style Setting Dialogが表示されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0013.png
13. カラーボタンFKが表示されている場合はそれをクリックします。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0015.png
    • カラーボタンがカラーボタンQに変わります。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0014.png
14. Setをクリックします。
15. Drawをクリックします。
    • Insert DNA上のカラー設定フィーチャーが設定された色で描画されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0017.png
16. 同様にPlasmid Regionに表示されたレーンにチェックし、Editボタンをクリックします。
    • Circular Lane Style Setting Dialogが表示されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0018.png
17. カラーボタンFKが表示されている場合はそれをクリックします。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0015.png
    • カラーボタンがカラーボタンQに変わります。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0014.png
18. Setをクリックします。
19. Drawをクリックします。
    • Plasmid Regionに上のカラー設定フィーチャーが設定された色で描画されます。
    • 
    • imcimgI05/IMC5204_C806_0022.png,50