実装製品・エディション
目的
注釈付き塩基配列ファイルを特定の制限酵素で消化切断し、それぞれを配列ファイルとして保存します。
操作の流れ
- 塩基配列の読み込み
- 制限酵素の選択
- 消化断片化
- 断片化配列のファイル保存
用意するもの・サンプル
- ソフトウェア:IMC SE,GE,AE,DS
- サンプル塩基配列ファイル(例): Bsub50Kbp.gbk
- 制限酵素(例): BamHI
操作手順
- 塩基配列ファイルをCurrentMainFolderにロードします。
- RE Recognition Buttonをクリックします。
- Enzyme Selection Dialogが表示されます。
- Select All ボタンをクリックします。
- Show Recognition Siteボタンをクリックします
- Recognition Siteウィンドウが表示され、制限酵素別の制限酵素サイトの数が表示されます。
- 例えば、BamHI制限酵素にチェックします。
- 右側のパネルにBamHI認識部位のリストが表示されます。
- Digestionをクリックします。
- Select Allをクリックします。
- Loadボタンをクリックします。
- 全消化断片が反応プールにロードされます。また、それぞれ断片毎にGenBankファイルが生成されます。
結果
- 断片化されたGenBankファイルが新規に作成されます。
- 操作の際、「Load」および「Save」した場合です。Saveしない場合は、破棄されます。