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IMC E02A キーワード検索機能概要

機能

  • GenBank / EMBL ファイルの Qualifier として記述されている内容を キーワード として検索が可能です。
    • たとえば、/product=”dehydrogenase”などと記述されている全 フィーチャー を抽出することが可能です。
    • 選択された Feature Key だけを検索対象にできます。
    • 検索領域 を限定できます。
  • キーワードは、スペースで区切ることにより、複数指定 可能です。
    • AND、OR、NOT指定ができます。
  • 検索結果フィーチャー への ジャンプ機能
    • 検索結果の ヒットリスト 各行をクリックすると、メインフィーチャーマップ はその ヒットフィーチャー が中央に表示されるように自動的に スクロール します。
  • 検索ヒット した フィーチャー を編集できます。
    • 検索ヒット した フィーチャーを一括削除できます。
  •  検索結果の ファイル出力 が可能です。
    • CSV、FastA形式 でファイル出力できます。

操作

  1. メニューから「Search -> Keyword Search…」を選択します。
  2. IMC729 G102 0001
  3. Keyword Search ダイアログ が表示されます。
  4. IMC729 G102 0002
  5. Keyword(s): フィールド に キーワード を直接入力します。
  6. IMC727 FX29 0066
  7. Keyword(s) ボタンをクリックすると、過去に使用したことが キーワード から選択できます。
  8. 検索する範囲を指定します。デフォールト では、ゲノム全域 が選択されています。
  9. その範囲内にある フィーチャーキー がもつ、Qualifier の値から キーワード が検索されます。
  10. 検索結果は1行ごとにリスト表示されます。複数の キーワード はスペースで区切り設定することが可能です。
  11. IMC727 FX29 0068
  12. この場合、検索結果は OR 表示されています。
  13. それぞれの単語ごとに検索された件数が表示されているため、チェックボックス の チェックマーク をはずすと、下部のリストから非表示となります。
  14. 検索結果画面 の AND ボタンをクリックすると、結果は AND 表示となります。

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