ゲノム解析ソフトウェア技術情報サイト

機能

• GenBank / EMBL ファイルの Qualifier として記述されている内容を キーワード として検索が可能です。
  • たとえば、/product=”dehydrogenase”などと記述されている全 フィーチャー を抽出することが可能です。
  • 選択された Feature Key だけを検索対象にできます。
  • 検索領域 を限定できます。
• キーワードは、スペースで区切ることにより、複数指定 可能です。
  • AND、OR、NOT指定ができます。
• 検索結果フィーチャー への ジャンプ機能
  • 検索結果の ヒットリスト 各行をクリックすると、メインフィーチャーマップ はその ヒットフィーチャー が中央に表示されるように自動的に スクロール します。
• 検索ヒット した フィーチャー を編集できます。
  • 検索ヒット した フィーチャーを一括削除できます。
•  検索結果の ファイル出力 が可能です。
  • CSV、FastA形式 でファイル出力できます。

操作

1. メニューから「Search -> Keyword Search…」を選択します。
2. 
3. Keyword Search ダイアログ が表示されます。
4. 
5. Keyword(s): フィールド に キーワード を直接入力します。
6. 
7. Keyword(s) ボタンをクリックすると、過去に使用したことが キーワード から選択できます。
8. 検索する範囲を指定します。デフォールト では、ゲノム全域 が選択されています。
9. その範囲内にある フィーチャーキー がもつ、Qualifier の値から キーワード が検索されます。
10. 検索結果は１行ごとにリスト表示されます。複数の キーワード はスペースで区切り設定することが可能です。
11. 
12. この場合、検索結果は OR 表示されています。
13. それぞれの単語ごとに検索された件数が表示されているため、チェックボックス の チェックマーク をはずすと、下部のリストから非表示となります。
14. 検索結果画面 の AND ボタンをクリックすると、結果は AND 表示となります。