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各種検索結果ウィンドウからClassification 値を設定します。

例えば、キーワード検索結果一覧から、ヒットしたフィーチャーに対して、ひとつの値を 「Qualifier /classification」フィールドに一括セットする機能です。

Classification コードはデフォールトでは部分的に COG のコードに準拠しており、かつ機能カラー分類機能を有するため、この機能を利用することより、環状ゲノムマップや、ゲノムマップの各フィーチャーを機能別にカラー表示できます。

「/classification=」 という Qualifier は、フィーチャーの機能分類用に IMC が独自に設定したものです。

Classification に値を一括設定できる検索

以下の検索機能において、Classification 値の一括設定ができます。

• Statistics
• Keyword search
• Feature Key (FK) search

操作

（例として、キーワード検索を使用します。Feature Key 検索や、Statisticsも同様に操作できます）

キーワード（複数指定可能）と検索対象フィーチャーキー（複数指定可能）を指定して、キーワード検索を実行します。

検索する注釈付きゲノム配列をメインカレントディレクトリ―にロードし、フィーチャーマップに表示します。

メニューから「Search -> Keyword Search…」をクリックします。キーワード検索ダイアログが表示されます。例として、CDSフィーチャーにチェックし、キーワードとして「transcription factor」をAND指定します。

「Run」をクリックします。

キーワード検索が実行され、「Keyword Search Result」ウィンドウが表示されます。

「/classification=」 に値を設定したいフィーチャーにチェックします。

「Sequential Number Setting…」 をクリックします。

「Sequential Number Setting」 ダイアログが表示されます。

「Qualifier」プルダウンメニューから Classificationを選択します。

「Prefix」 入力フィールドに、「/classification=」 に設定する文字列（通常COG コード）を入力します。

この場合は「TR」を入力しました。登録されているClassification Codeについては、こちらをご覧ください。

Run ボタンをクリックします。

設定が実行されます。

実行が完了すると、「Completed !」確認メッセージが表示されます。

「OK」をクリックします。

確認メッセージが閉じます。

指定されたすべてのフィーチャーの「/classification=」 に設定した文字列がセットされます。

設定確認方法

上記の操作の結果確認方法には以下の機能があります。

• フィーチャーマップにて、Classifcation カラー表示ボタンをクリックして、フィーチャーマップ上のフィーチャーをClassification カラー表示します。
• 環状ゲノムマップを作成し、カラー表示をClassification とします。
• Classification 検索を行います。